La Institución Educativa Isabel La Católica se encarga de orientar las acciones que garantizan el adecuado funcionamiento institucional, centrando sus esfuerzos en el direccionamiento estratégico, la construcción de una sólida cultura escolar, la promoción de un clima organizacional armónico y el fortalecimiento del gobierno escolar. Bajo el liderazgo del rector y con el acompañamiento de las dos coordinadoras, este equipo de gestión organiza, desarrolla y evalúa los procesos académicos, convivenciales y administrativos, generando las condiciones necesarias para el cumplimiento de la misión institucional y la formación integral de los estudiantes.